最终，冯玉祥曾经的部下们，吉鸿昌被蒋委为第二十二路总指挥后，即调赴豫、鄂、皖边境，归豫鄂皖边区绥靖督办李鸣钟节制；梁冠英为第二十五路总指挥，调赴苏北，归江苏绥靖督办张之江节制；葛运隆为第三十三师师长，所部由洛阳调赴湖北；停留在焦作的孙连仲也自谋出路，派田镇南、李汉辉到济南，通过韩复榘的关系，接受了蒋介石的第二十六路的任命。就连冯的卫队旅季振同部也愿随孙共同行动，不愿退往山西。而曾经追随冯玉祥的庞炳勋、孙殿英、刘春荣等部则干脆脱离西北军。

10月8日，冯玉祥到石家庄与阎锡山会面。鉴于大局败坏，已经回天乏力，而蒋中正又坚持阎、冯二人必须下野，便商定阎锡山把军政交与徐永昌，冯将西北军交与鹿钟麟，他们两人出国暂避。阎锡山回到太原后，便将军政作了安排，并声言去日本游历，实际上却只是去了大连。

而冯玉祥到了晋城，却没有出国远游的意思，仍然希望掌握西北军残部开赴西北另谋出路。这个残部是在宋哲元、张自忠、刘汝明、童玉振、孙良诚、秦德纯、赵登禹、张维藩等人的分别带领下，陆续退入山西的，一共约有6万多人。但这个时候，鹿钟麟却从自己派往南京接洽代表所回的电报中得知，蒋中正坚持冯玉祥、鹿钟麟必须下野。随后，鹿钟麟去往天津，出漾电，声明下野。

就这样，冯玉祥惨淡经营，名噪一时的西北军就此分崩离析。冯记西北军彻底成了过去时。

与冯玉祥所部彻底瓦解的结局不同，阎锡山所部的晋绥军却基本上都撤了下来，特别是徐永昌在陇海线上指挥的晋绥军，几乎算得上是全师而还。

由于提前接到阎锡山的密令，加上此前徐永昌就有所准备，因此陇海线上的晋绥军是有组织的交替掩护撤退。在过黄河时，徐永昌所部除了受到降蒋的梁冠英部炮击，将桥头堆放的弹药一度爆炸引起惊慌外，别无损失。甚至连野炮、山炮、机枪等重火力装备都全部运回黄河北岸。

10月中旬时，徐永昌全师回晋，津浦路晋军在遭受严重损失后也按建制回到山西，整个晋绥军虽遭受了一定损失，但未伤元气。这成为后来阎锡山东山再起的资本。

而阎锡山在得知这一结果后长长地松了口气，10月26日，阎锡山委徐永昌为晋绥警备总司令，杨爱源为副司令；赵承绶为绥远守备司令；王靖国为晋东边防区守备司令，李服膺为副司令；杨澄源为河东区边防守备司令，关福安为副司令；杨效欧为潞泽区守备司令；张会诏为平绥路区守备司令；李生达为孟辽区守备司令。

只是，阎锡山、冯玉祥两人虽然都通电下野，表示要出洋，可两人却都不想离开山西。老蒋却不会和这两位战败者客气。10月28日，中央军飞机到太原投弹，炸死4人，伤8人，并散传单，限阎、冯于两周内离境。

可即便这样，阎锡山也没有按时离开，而是磨蹭到11月29日，才离开五台老家，经大同到天津后乘船去了大连。而冯玉祥则干脆到山西汾阳隐居起来。由于西北军已经彻底被瓦解，老蒋和张学良对冯玉祥并不怎么担心，对其并未逼迫过甚。

历时长达半年之久的中原大战以反蒋联军的失败而告结束。这场双方出动兵力百万以上，死伤30多万的国民党新军阀之间的混战，在整个民国历史上有着极其重要的影响。

在这场大战中，输家不仅仅是阎锡山、冯玉祥等反蒋联军，一定意义上说，蒋中正也是一个失败者。他虽然赢得了战争的胜利，却在政治上输了。被蒋打倒的阎、冯、桂系等军阀心底从来就没有真正服过老蒋，甚至蒋军一方中人也并非就完全信服他。这从其后的福建事变、察哈尔同盟军、两广事变，甚至桂系借中.共之手使蒋第三次下野等等事件中都可略窥一二。

当然，中原大战还有一个最大的输家，那就是国民党政权。除了因这场大战而导致的民心大失之外，在这次大战中，作风彪悍的西北军作为一个集团消失了，剩余的是蒋、阎、张以及桂系这四大势力。而这四股势力在这两年中却各有损伤，彼此之间又勾心斗角。国民党统治阶层的这种状态，以及国内民众因大战而对政府的失望，难免给窥见了虚实的国内外其他势力以可趁之机。从此后，华夏大地便开始进入内外交迫的多事之秋。