不过，即便青马、宁马败退，杨虎城部、井岳秀部、鲁大昌部以及绥远王、赵两部的兵力也仍然有6万多，还有再战之力。只是，要是与青马、宁马对阵的人民军增援上来，那结果可就不好说了。
就在杨虎城犹豫着是否继续打下去的时候，老蒋却在21日给他来了一道电令，说是共匪张国焘部自鄂豫皖逃离后，一路西去，有向豫陕边界一带逃窜的迹象，要求杨虎城部立刻调集兵力在陕南布防，务必配合各路追剿部队将该部共匪彻底歼灭。
中共鄂豫皖苏区在老蒋的重兵围剿下，张国焘部被迫西撤。在河口镇一带，经过苦战后，张国焘部于10月11日突出重围，连夜越过平汉铁路，向鄂西北地区转移。得知消息后，老蒋立刻调集大军对其围追堵截：以刘茂恩等部在襄阳、枣城、宜城地区依托沙河堵截；以卫立煌部跟踪追击；以肖之楚部在南面沿京山至宜城公路平行追击；以胡宗南部在北面沿花园至襄阳公路平行追击。
10月19日至20日，老蒋所调派的各路大军在新集一带又对张国焘部形成合围，但却再次被该部突围。不过，在几路追兵的逼迫下，张国焘部已无法再打回鄂豫皖根据地，被迫向西面的豫陕地区转移。
接到老蒋的电令后，杨虎城立刻感觉自己的脑袋大了一圈。这边的人民军还没解决呢，那边又要过来共军。现在陕南除了西边南郑一带有马青苑损失不少的一个警备旅外，东边只有民团和少量驻军，根本就承担不了阻挡共匪西进的任务。若是这共匪、民匪合流一气，恐怕这陕西非变天不可！西北局势也将彻底靡乱
当下，杨虎城不敢怠慢，一边将眼下围剿人民军的战况上报老蒋，一边着手布置有关退兵事宜。尽管尚未得到老蒋回电，可杨虎城明白，两害相遇取其轻，与人民军相比，共匪才是老蒋的心腹大患，老蒋肯定会同意自己撤兵的。
果然，老蒋的电报很快就到了。不过，虽然同意杨虎城撤兵，但通篇电文却找不到任何“撤兵”字眼。老蒋只说此战失利，当着手整顿兵备以便下次再战，但防备共匪西窜乃当务之急，切不可怠慢云云。
就杨虎城自身来说，因为以前曾和中共人士有过不错的来往，实在不愿意配合老蒋剿共，但现在陕南空虚，若是自己不派兵增防，不光中共武装将长驱直入，就是老蒋的中央军恐怕也会赖下不走。那样的话，只怕陕南从此以后就不属于自己这个省主席管了。
一番盘算后，杨虎城决定撤兵。在留下孙蔚如师两个旅、马青苑师一个旅分别监视陇东、陇中的人民军后，两师其他部队加冯钦哉师一个旅增兵陕南。
随着杨虎城撤兵命令的下达，井岳秀、王靖国、赵承绶等部也陆续撤退。西北根据地所经受的第二次围剿作战就这样不了了之。
就在杨虎城增兵陕南后不久，11月中旬，杨虎城部的3个团在陕南漫川关一带挡住了张国焘部的去路。在与追击而来的胡宗南部的配合下，将张国焘部包围压迫于康家坪至任岭十余里悬崖峭壁的峡谷中。似乎大功就要告成，但张国焘部却又一次突出重围，并在其后经库峪、汤峪进入关中平原，威逼西安。
接下来的日子，就是杨虎城和胡宗南等部与张国焘部斗法了。而西北根据地在打破敌人的第二次围剿后，开始清点战果，加紧进行各项建设。
由于人民军对各路敌军实施不同程度的打击，此战的可见战果基本上都是在青马、宁马身上取得的。除了缴获青马、宁马各种枪械21000多，击毙青马、宁马共计6千余人，俘虏共计17000余人。这样算下来，逃散四野的加上跟随青马、宁马逃离的，一共不过14000人。让诸马带这样的兵力入疆，这与赵振中等人原定的目标基本相符。
此战后，西北根据地在河西走廊上又增加了临泽、高台两个县，增加人口8万左右；在湟中、湟源一带，增加了大通、湟源、互助、西宁等县市，增加人口30万左右。这使得西北根据地扩大到74个县市，面积约有32万平方公里，人口达到530万左右。
实际上，青海省内其他地区也再无能与人民军对抗的力量，只是眼下冬季将临，考虑到后勤方面等问题，人民军各部一时来不及去占领罢了。若是依此来算，加上整个青海省，西北根据地的面积将达到近百万平方公里。当然，由于青海地广人稀，人口增加的幅度不会大，估计整个根据地人口将接近600万。
10月28日，在人民军作训中心，各纵队的一把手和周昊齐聚一堂，将清理出来的战果向大家通报后，张明瑞说道：“单看收获数字，这次作战似乎没有上次的战果大，但实际上，通过此次作战，我们已经改变了西北根据地遭受敌人四面围攻的战略态势。今后，我们除了在一定时期内奉行对北、对东两个方向上的防御外，可放手向西展。”
此战后，青马、宁马再不足为虑，人民军向西展的大门已被打开。只要根据地各方面积蓄足够的力量，随时可全占河西走廊和青海。而由于中共武装在陕南和关中北部出现，陕西、陇南等地的敌军在分心旁顾之下，也难以集中兵力向人民军再次动攻击。西北根据地所面临的形势确实极为有利。
“除了形势有利，我们可以集中力量加快根据地建设外，还应当看到，我们面临的困难同样不少。”张明瑞头脑清醒地继续分析道，“主要是根据地的各项建设还需要进一步加强，这包括政权组织建设、农田水利建设、交通建设、工农业生产建设等众多方面。因此，在下一次战役来临之前，我们必须要集中力量解决好这几个方面的问题，为根据地的进一步展打下牢固的基础。”。.。
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